可变剪切(小麦基因id转换)

精英怪
广告

小麦基因id转换

可变剪切(小麦基因id转换)

小麦中国春基因组有众多版本,也有了众多的基因id。

不同研究之间使用的id不同,就不容易做比较。

如果想要知道是不是同一个基因,往往需要使用blast进行搜索,比对等。

今天我们提供一个基因id转换的小工具,可以将以前版本的基因id转换成最新版的基因id,即IWGSCv1.1版本。

http://202.194.139.32/idConvert/

一次最多可以提交100个基因。我们也有提供所有基因的下载链接,如果需要可以自行下载。

结果如下所示:

其中code一栏,在提交页面有一张图片进行了解释。如上述结果中,字母j表示查询的TGAC转录本和1.1版本的转录本是可变剪切的关系。

下面这张图片是相关的字母解释

其实,我们前面也推送过一次基因ID转换的内容。

小麦注释基因不同ID之间的转换

这还是只是一个基因组的不同基因id之间的转换。现如今,小麦也有了众多的基因组,每个基因组都从头注释一遍也不太现实。在多数情况下,是可以将中国春基因直接对应到其他基因组上的。当然也可以将小麦祖先物种的基因对应到中国春基因组上的。如果大家急需,请留言或者点赞吧。

发表评论

快捷回复: 表情:
AddoilApplauseBadlaughBombCoffeeFabulousFacepalmFecesFrownHeyhaInsidiousKeepFightingNoProbPigHeadShockedSinistersmileSlapSocialSweatTolaughWatermelonWittyWowYeahYellowdog
评论列表 (暂无评论,457人围观)

还没有评论,来说两句吧...